1) надо попробовать позапускать чо-нить такое...

2) Проверить с LiveCD линуксовым.
3) Если в п.2 все намана - значиццо, венда виновата. Если вирус 100% исключен, то как вариант - переставить драйвер сетевушки, поиграться со скорость. подключения оной (10-100, half duplex - full duplex)... Как-то так...
О! Стоп! Есть еще один вариант! Раутер, случаем, не Ambit ХОТ-овский? Там внутре есть такая хрень , что-то связанное с дефрагментацией пакетов, в настройках фаервола. Симптомы точь-в точь, как описанные. У друга такая фигня была: один комп работает, как часы, а второй - глючит именно так, как сказано. Убрали галку (или поставили - не помню) - все заработало.